Il Dipartimento di Medicina Sperimentale è suddiviso in cinque Sezioni: Biotecnologie e Biologia Molecolare; Farmacologia; Fisiologia Umana e Funzioni Biologiche Integrate; Igiene, Medicina del Lavoro e Medicina Legale; Microbiologia e Microbiologia Clinica. Decine i laboratori all’avanguardia per tecnologie, che portano avanti numerose linee di ricerca.
Sul piano delle attività formative, afferiscono al Dipartimento il corso di Laurea Magistrale a ciclo unico in Medicina e Chirurgia - Sede di Napoli, il corso di Laurea Magistrale in Scienze infermieristiche ed ostetriche ed il corso di Laurea Triennale in Informatore Medico Scientifico; sette Scuole di Specializzazione; nove Master. Il Dipartimento è inoltre la sede amministrativa del nuovo Dottorato di Ricerca in Medicina Traslazionale.